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变异区编年史是根据潜行者三部曲的剧情（不参照MOD）发展的先后顺序为主线，结合了GSC官方公布的“Stalker时间线”，加入游戏当中的百科内容编稿而成。编年史当中有部分内容是真实存在于当今世界并非完全虚构，为了更加丰富和完善编年史的内容，让潜友更加了解故事背景而有选择性的加入。其中难免有一些情节和三部曲内容冲突，因为游戏当中的内容也有自相矛盾和阐述不清的地方，所以我根据多年来的游戏经验以及对剧情发展的推测后修改而来。
变异区，又名特异区、隔离区，英文名叫Zone或The Zone，是指1986年切尔诺贝利核泄漏事故之后，因生化及辐射污染，政府为防止环境恶化进一步扩散，以及保护不为人知的秘密实验，隔离出以核电站为中心，方圆三十公里的无人区，并严禁任何无许可人和车辆组织进出。在1986年事故发生至2006年第一次大灾变之前，称为隔离区，2006年第一次大灾变之后，变异区正式形成，称为“变异区”。
特异区的起源
特异区的起源
1875年，奥地利地质学家爱德华·苏威斯最早提出“生物圈”概念。
1926年，苏联地球化学家弗拉基米尔·伊万诺维奇·维尔纳茨基（以下简称维尔纳茨基）明确了“生物圈”的定义——生物地球化学。
1927年，维尔纳茨基成立了生物地球化实验室。
1935年，维尔纳茨基引入专业名词“生态系统”将生态学定义为研究生物圈的科学。
1942年，“斯大林格勒战役”后，苏德战争发生逆转，苏联开始战略性反攻。
1943年，“切尔尼戈夫-普里皮亚季河”战役爆发，随着苏德战争成果的扩大，为解决德军战俘的安置问题，苏联政府在切尔尼戈夫附近修建利曼斯克劳改营，用以安置德军战俘。
1945年，维尔纳茨基根据“生物圈”的定义提出“智域”（即人类圈或智能圈）的概念。苏联科学家认为，地球包括所有具有认知能力的居民被一个特殊的信息场域所包围，即所谓的“智域”。后来，科学家通过计算认为，如果小范围的调整“智域”能够对人类思维进行改善，而如果对“智域”进行大量影响甚至操纵，就有可能达到控制人类思想的目的，换句话说，如果谁掌控了“智域”，就等同于掌控了地球。这是苏联政府进行“共同意识”研究的理论来源和依据。
1955年，生物物理博士姜堪政发现并提出了生物电磁波的存在，这为后来苏联进行“通过生物电磁波影响人类思维”的研究提供理论依据。
50年代末，利曼斯克开始由劳改营转变为生活城市，劳改营的德军战俘被秘密转移，下落不明。随后，政府开始有计划的安排居民入住该城，人口以每年新增800~1000人的速度增长。
60年代初，农业研究所成立，最初作为苏联农作物的育种和遗传研究机构，并配有一块试验田。但实际上该研究所是用于秘密研究“意识控制”，并取得中度成功，研究人员能够对动物的心灵进行简单的控制。在农研所取得的研究成果开始应用和分享到部分研究室。
60年代中期，苏联政府开始研究反弹道导弹的早期预警雷达，并开始修建Duga系列预警系统，实际上是苏联思维控制发射器的雏形。
60年代末，苏联政府在利曼斯克附近的一个高地上修建一座气象控制设备，名义上是该镇的公共基础设施之一，实际上是一座实验型生物电磁波发射站和无线电研究所（可能是曾被相关文件提到的X-7实验室），试图将利曼斯克作为一个精神控制的实验场所。
1970年，普里皮亚季建立，为安置兴建切尔诺贝利核电站的建筑工人和工作人员及其家属。同时，普里皮亚季最高建筑之一——波利西亚酒店开始修建（26号房间所在旅馆）。
1973年，苏联政府开始修建切尔诺贝利核电站，并在切尔诺贝利和切尔尼戈夫附近建造DUGA-3远程警戒雷达系统。
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1975年，利曼斯克陆续出现冲突事件，调查显示当地居民普遍都患有不同程度的焦躁症和偏头痛，他们对无线电研究所的科研工作人员以及其他外来人员产生一种轻敌对的负面情绪和不信任感。
1976年7月起，世界范围内开始在短波频段上收听到苏联DUGA-3远程警戒雷达发送的短波信号，由于该信号听起来就像是尖锐的敲击噪音，大约每秒钟重复10次，所以被冠以“俄罗斯啄木鸟”的名头。
这为后来“集团”发射高强度的生物电磁辐射波提供实际的物理依据和技术支持，该设施在“集团”成立后由电子通信工程项目部门负责。
1977年，切尔诺贝利核电站1号机组启用，苏联政府开始利用切尔诺贝利核电站和普里皮亚季附近的偏远地区研究和开发精神武器，研究“智域”空间。
1978年，2号机组启用。
1981年，3号机组启用。同期，苏联政府在黑暗山谷修建X-18实验室，开始制造“凯曼诺夫实验发射器”（英文名Kaymanov，是焦脑器最早的实验形态），主在研究活体细胞的电磁波对心灵感应的影响。由于长期接暴露在实验性辐射环境内，研究人员发现实验活体开始出现生化变异，并记录在案，实验数据分享和应用至其他相关研究所和实验室。
1983年，4号机组启用，切尔诺比利核电站全面运行，核反应堆的强大动能为“智域”空间的研究提供绝对的电力供应，实验测试的次数和规模开始频繁和扩大。
1986年4月26日1点23分，科学家第一次对“智域”空间的作用进行实验，激增的能源消耗以及功率波动导致切尔诺贝利4号机组反应堆发生爆炸，堆芯焚毁，造成震惊世界的核泄漏事故，事故所造成的后果极其严重。
事故发生后，为了保护科研秘密和成果，苏联政府连夜转移实验室和工作人员，直到30个小时后，才立即对发生地周围的居民点进行了紧急疏散，包括普里皮亚季、利曼斯克、切尔尼戈夫、死城在内的数座城镇以及上百个村庄被废弃。核电站周边方圆30公里的污染地区成为了严禁进入的疏散后隔离区。
但是事故对于秘密研究项目来说并不是坏事，反而可能是一个福音，因为政府在切尔诺贝利核电站事故机组上建造了被加强的“石棺”进行覆盖处理之后，恢复工作的部分机组提供电力，当地存在的许多高功率天线以及无人区的环境，使隔离区成为最理想的实验场所，随后几年内，实验室的活动行为比之前增加了两倍。
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1986年5月，核泄漏事故发生后，农业研究所被迫关闭，试验田被焚毁。苏联政府借修建石棺的名义，在杨塔湖底立项修建X-16实验室，将农研所实验室的部分研究转移至此。
1987年至1989年，农业研究所重新启动，表面上用来研究辐射土壤对作物的影响，但实际上继续配合着“意识控制”项目进行秘密实验，并建有一座小型军营进行安全管理。但是由于政局动荡，研究所的新任务并未被安排且无法向公众透露，基本丧失了资金来源。
同期，农研所汽车工厂建立，用来消除车辆受到的辐射。
12月25日，苏联解体。但苏联的解体并未影响隔离区内秘密实验项目的进行，新生的乌克兰政府此时正忙于解体后的政府组织工作，无暇顾及也无力阻止隔离区相关研究所的运作。虽然“C-意识”的许多附属研究项目已经停止，但主要项目的几个负责人并不愿意停止研究，他们成立了“集团”组织，接管主体项目和包括农研所在内的部分资深实验室，继续开展“C-意识”的研究和精神药物的研发工作。而除了“C-意识”项目，研究还包括心理控制、洗脑、记忆改变和人类心灵的彻底破坏，以及因这些项目而分支的其他科研工程。该组织主要目标是影响人类思维，创建“共同意识”。
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1994年，在乌克兰经营餐馆的酒保，为了反击当地的暴徒而过失杀人，最后进入变异区继续重操旧业——开设100辐射酒吧。由于良好的信誉、优越的交通位置以及卓越的商业眼光，100辐射声名鹊起并逐步发展成为隔离区最大的情报中心和交易地点。
1996年至2006年，“集团”在石棺内部安置了一个黑色复合晶体——“许愿石”，用以进行生物电磁波发射装置的初步原理测试。“许愿石”以“实现愿望”来吸引人类，一旦成功吸引人类并洗脑，就派他们去守护隔离区的秘密，这是黑石组织最早的雏形。随着被吸引人数的增加，以及出于秘密实验需要安保措施的需求，“集团”在石棺内部建立了一个“战争实验室”，召集和培训战斗精英进行洗脑和记忆改变，成立黑石组织。“C-意识”担任实验室主任，指挥领导黑石部队。
1998年3月6日，核电站当地承包商的工程师们声称6号机组被建在深远的中心地带，有人认为他们是用于一些奇怪的心理测试，存在投机行为目的。
同年，史特列洛克进入隔离区。
1999年2月22日，乌克兰政府成立调查委员会，调查隔离区内的非法活动和奇异事件。该委员会证实了隔离区内发生的奇异事件以及部分非法活动，但政府并未采取实际行动。
2000年，“集团”科学家发现活体生物的大脑能产生生物电磁波，开始在杨塔工厂地下X-16实验室开展研究，用以掌控这种活体大脑的生物电磁波的产生原理，并将这种电磁波命名为“生物电磁辐射”。
12月15日，乌克兰政府宣称已彻底关闭切尔诺贝利和电站的运行，在事故发生14年后核电站才正式关闭，其中的真相引人遐想。但实际上，乌克兰政府并未真正掌控切尔诺贝利，核电站内部依旧在运作。
2001年初，“战争实验室”部门召集核物理学、电磁物理学、电子科学和武器学等相关部门的研究人员，在木星地区共同开发高科技尖端武器——高斯步枪，代号“62号”。
高斯武器的研发，主要有两个目的，其一是为有效反击政府军的入侵提供强大的火力支援；其二是为更好控制生物基因改造工程的产品，防止这些变异物种的反噬。
2001年夏，隔离区开始引起注意，出现了一些关于奇异现象的谣言。普里皮亚季城不断出现奇异现象，还出现了奇怪的生物。后来，一辆满载外国游客的公共汽车在隔离区完全消失。
2001年12月21日至25日，乌克兰国家安全局的V.M.克鲁切尔尼科夫上校派遣D.F.梅克赛门克上尉率领3名调查员和一支SBU特种部队前往农研所进行搜索。
2003年，彼得·丹尼洛维奇·斯特里茨博士开始领导农研所的工作。农研所针对农业方面的研究开始停滞，转而开始采购“集团”秘密实验所需的，无法通过正常渠道获得的设备物资以及募集资金。
2004年7月，“集团”关闭了在木星工厂关于电磁武器（代号“62号物品”）的研究，黑石组织通过普里皮亚季地下一号通道转移了“62号物品”和相关科研人员。为了不引起格外关注，初代产品在普里皮亚季河流域内一个不起眼的河湾地区进行实验，并建立一个中型发电站为其提供电力和动能。
2005年起，超自然的力量开始影响到欧元区甚至扩散到更广泛的地方，重大气候的模式出现改变，包括飓风和地震。
2005年初，农业研究所明面上的辐射作物研究项目已全面停止工作，在农业研究所负责人彼得·丹尼洛维奇·斯特里茨博士的授意下，研究所开始谎报项目和伪造官方文件，利用申请的政府资金，进一步为秘密科研项目采购设备和提供物资。
2005年6月，“集团”根据X-18的实验结果，对“凯曼诺夫”实验发射器进行放大改造，结合活体大脑能产生生物电磁辐射的理论，创造出新的发射器——生物场发射器，一个巨型的人工“大脑”，并在X-18实验室组装完成后运往X-16实验室进行安置。
2005年7月，高斯武器进入实枪实验阶段，被缩小改造成单兵作战武器，在普里皮亚季和利曼斯克地区进行实验，初步达到击落军用直升机的效果。
2005年10月，X-16实验室启动生物场发射器，进行小规模的电磁辐射实验，取得初步成功。随后，科学家发现发射器的大体量和强劲的能源可以发射高强度的电磁辐射，其强度远高于人类大脑所能承受的极限，其结果是对活体大脑的思维产生强烈的激化作用（焦脑性质），研究人员将新发现的放射性电磁波命名为PSI射线（又名PSI辐射，简称PSI）。
2006年2月，军方再次深入变异区并重新占领陆军仓库，修建基础工事。
2006年3月1日，“许愿石”发射器和“战争实验室”相继完成。
3月4日，“C-意识”第二次尝试与“智域”进行空间作用的实验，但因为实验本身所需的巨大能源导致核电站超负荷而停电，实验失败。
大灾变的爆发
大灾变的爆发
2006年4月12日02点33分，“C-意识”再次尝试与“智域”产生空间作用，但实验过程中发生相互反弹，“智域”出现裂痕，导致空间能量和磁场极不稳定，从而导致极度白光和剧烈爆炸，产生第一次“极光事件”（大灾变），雷击和地震随之而来。
这次实验不仅没有达到预期的效果，相反，强大的空间反作用直接影响甚至改变了隔离区的生物圈，创造出一个大面积的反物理规律地带，连科学家都无法理解和解释这些变异现象，大灾变后，隔离区的半径扩大了5公里，并出现了变异点，致命情况比比皆是，变异区彻底形成。
发生第一次“极光事件”时，爆炸核心周围的人员和大部分镇守在边界的军队和科研小队当场死亡，但仍有许多在隔离区的人员存活。陆军仓库的工人和军人来不及撤离，留下大批车辆和原料物资，军方仓库开始被真正被遗弃，突变体和其他野生动物迅速进入。
可怕的灾难后果导致“集团”内部中立思想派的出现，其后在关于实验是否继续和实验失败后的处理问题等方面发生分歧，最终导致该组织发生分裂，大约一半的科学家和研究人员离开。
其中三人（N.A.列别捷夫，V.I.苏斯洛夫和E.F.卡兰察）成立了晴空组织，旨在以静态方式研究变异区，并找到一种方法来消除“智域”作用，或至少包容它，以便与变异区共存，这是变异区最早的潜行者组织。
另一半留下的科学家利用现有技术融入了“C-意识”，他们认为上述问题可以通过进一步研究”智域”来得到解决，并学习如何控制它。事实上，科学家们确实很快学会了掌控“智域”，但是其代价极其高昂——“智域”空间所蕴含的能量过于庞大以至于他们无法在短时间内消化，最终只能以风暴的形式进行定期的能量排放，这导致PSI电磁辐射风暴的出现。
4月13日，军队重新隔离了变异区并开始执行拯救任务，但马上就发现拯救行动是徒劳无功的，所有被送往该区域的人员和机器马上出现死亡和失效，危机形势达到顶峰。
4月15日，军方和政府科学家立即对“极光事件”进行调查，卫星确认爆炸的核心在距离核电站中心1公里的地方，据不完全的情报推测，应该是该地进行一些实验失败后造成的灾难。但是大多数证据已经在事件中被毁，调查毫无头绪最后终止。
2006年6月10日，发生第二次“极光事件”，导致第一次PSI风暴，变异区半径再次扩大。据相关报告，变异区先是突然出现了极其强烈的亮光，在极短时间后又消失了，光线甚至使空中的云彩瞬间蒸发。随后出现的是强烈的辐射排放和地震，大部分毫无防备的军人以及研究人员立即被莫名其妙的杀死。剩余的人员不断要求撤离，但已无济于事，因为当时的环境任何设备都无法进入隔离区执行撤离任务。
2006年7月，在第二次“极光事件”发生后，外部世界的人员开始陆续闯进变异区，他们自称潜行者，带着发财致富的愿望以及逃避法律制裁等各种各样的原因在变异区游荡。最初潜行者人数稀少，可以通过贿赂守边军队进入变异区。但随着人数和武器的增加，军方认为潜行者已经达到了足以威胁变异区边境守卫士兵的地步，开始展开对潜行者的围剿，潜行者和军队之间的微妙平衡被打破，中立关系破裂。
2006年7月，X-18实验室开始进行PSI活体生物实验，对受试者样品进行不同程度的PSI调节测试，测试初期未发现变化。一周后，受试者发生变异，开始出现脱发和攻击倾向，在受试者的情绪趋于稳定后，只有10%的头发残留，爪子和牙齿大大增长。攻击活动看起来像是随机行为，但未针对它们的同龄人，技术主管A.N.伯诺夫博士开始推测受试者的智力获得增长。因此，实验被授权进行第二阶测试，决定对受试者调节至新的PSI强度。
7月14日，实验室安保警卫G.P.格列博夫朝受试突变体（已不再是受试者，因为此时受试者的变异已经偏离了人类属性）扔了一块肉，起初只是为了好玩，受试突变体开始吞噬，随后试图挣脱实验容器，导致实验室技术人员无法获得测试样本，为了安全起见，实验室研究人员被授权在紧急情况时可配备武器。
7月22日，PSI实验发生失控，受试突变体袭击了两名研究人员，破坏了主实验区以及两个附属实验室，所幸的是研究人员及时将自己锁在了主厅外，避免人员再次伤亡。
7月23日，实验室负责人皮欧特·里奇·卡鲁金博士命令清理实验室，在执行过程中，3名安保人员被杀，安全事件和恐怖的蔓延使大多数工作人员期待实验尽早结束。
2006年8月2日，X-18实验室的测试进入最后阶段，对受试突变体进行更高强度的PSI测试，结果直接导致受试突变体大脑焦化，测试结果与其他实验室的成果完全一致，实验被认为是完整的，并将在一周内对大型生物进行测试。
8月6日，针对大型生物的PSI测试开始进行，但当测试进入尾声时，受试生物开始爆发猛烈的攻击行为，并打开了剩余的受试容器，释放其它生物，直接摧毁了实验室，数名研究人员和安保人员当场被杀。在普通武器对受试生物无法起到有效遏制后，存活的工作人员通过一系列的密码安全门将自己锁在了主厅外，但是受试生物通过通风管道找到剩余人员并将其杀死，实验室负责人皮欧特·里奇·卡鲁金博士当场死亡，X-18实验室停止工作并废弃。
2006年9月，杨塔X-16实验室的生物场发射器因高强度PSI辐射使人类无法正常靠近，最终陷入失修而遭遇废弃，所有科研和工作人员开始撤离，但发射器仍然照常运行，这导致明显的灾难性后果。
许多潜行者和部分小型团体贪图清扫这个工厂以获得丰富资源甚至神器而前往杨塔，但都不幸成为PSI辐射的牺牲品，开始僵尸化，导致杨塔地区僵尸数量急剧上升。
2006年10月，意识到“智域”研究需要更多的时间来寻求解决方案，为了防止实验受阻，“集团”在生物场发射器取得成功的基础上，对普里皮亚季的X-8实验室的“焦脑器”开始改进，并在12月组装完毕运往天线地区的X-10实验室进行安放，准备利用前苏联时期遗留的Duga-3视距雷达将PSI射线传送到大气层。但随后研究人员发现，Duga-3过于庞大，功率范围达到2500公里以上，如果采用此系统发射PSI，将会瞬间引起全世界的注意，这不符合“集团”的利益。
因此，电子通信工程项目部门对Duga-3进行原理仿造，建成4座辐射范围不到10公里的天线塔，既保证PSI辐射能有效进入大气层，同时也形成一定的防御范围，防止任何人员进入变异区核心地区。
2007年，乌克兰国家科学院开始派遣科学考察队探索变异区，但所有派出的考察队几乎都是以悲剧结束或者下落不明，仅有的几名生还者向上级提交了遭遇拥有恐怖技能的异种生物报告，但未发现明确的实体。
同年，“向导”进入变异区。
2008年起，在第一次大灾难事件的两年之后，变异区境内的死亡人数攀升，人类和野生动物大量死亡，一些建筑开始倒塌，森林也遭遇焚毁。军队重新封锁了核电站周边方圆三十公里的区域，但政府科学家仍然无法解释切尔诺贝利核电站到底发生了什么事情，而变异区还在继续扩张。
同时，军方联合科学家派出的军事科研考察团在变异区局部地区发现了一些不可思议的变异点，还发现了一些异种生物，这些生物拥有令人恐惧的反常结构和变异能力，但科学家确信大自然不可能在短时间内进化出这样的生物。
2008年秋，爆发第三次“极光事件”，农研所在灾难破坏之后陷入瘫痪，主体项目被迫放弃，农研所负责人斯特里茨教授在请示“集团”高层之后开始转移。撤离前斯特里茨命人摧毁农研所地下实验室的核心主体和主通道入口（农研所大楼电梯底部），并带走全部文件资料。
因时间仓促，实验室内部通风和排水系统并未全部破坏，仍正常运行。
潜行者们的介入
潜行者们的介入
2009年起，乌克兰政府开始着眼于变异区，成立军事调查组和科学考研组对变异区进行调查和探索，情报表明大约有将近300名的不明人员在无人区内活动。他们把自己叫做"潜行者"，他们的主要目标是搜索一种叫做"神器"的东西，大致是一种未知的矿物，这种东西在黑市上很值钱。
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2009年5月，多年来政府派遣的军事调查组和科研考察团的行动相继失败，许多在变异区内执行任务的士兵甚至特种部队在遭遇变异生物和变异点后几乎被杀，幸存下来的人员先后逃往辐射100酒吧进行避难或成为普通潜行者，他们见证了一些该区域的恐怖事件，并决定做些什么。
这些军人和科学家以塔琴科、科斯马克、沃罗宁为首，为了抵御变异区的恶劣环境以及自身的生存，在罗斯托克工业区共同创立了纪律团组织，网罗和招募退伍军人、资深潜行者加入，这也就解释了为何纪律团能与军队和科学家有着千丝万缕的联系。
2009年9月28日，一组基辅科学家成功的创建了一个特殊装置，可以在10外探测到变异点活动。
2009年冬，配备了防护服和探测器的科研考察小队设法深入变异区1公里，最后全部安全回归。
2010年8月17日，科研考察队再次深入变异区并抵达首批潜行者曾废弃的营地，在那里发现了他们的第一个神器。
到2010年末，尽管在封锁线的边缘，参与这种"潜行者生涯"的人数急剧增加，但只限于变异区的外围，因为几乎所有试图深入变异区的尝试都以失败告终，这使得一些潜行者开始怀疑政府对变异区进行了某种掩盖和垄断。为了打破这种迷局，一些无政府主义者和流浪潜行者开始自行研究变异区，并且不约而同的集合在一起，组成一个以契科夫为首的户外实验团队，该团队奉行变异区的绝对自由，旨在向公众开放变异区、神器和变异点。
2011年初，纪律团为躲避辐射风暴而准备寻找新的营地，最终将目光投向遭遇废弃的农业研究所，纪律团创始人塔琴科派遣克雷洛夫开始在该地进行施工工作，同期，塔琴科计划摧毁变异区，他率领一支由军事专家组成的突击队伍深入变异区，打算利用核爆炸将变异区彻底摧毁。但从此塔琴科及其小队下落不明。
传言有潜行者在木星的冷却塔附近看到一支纪律团部队在没有探测器、向导和缺乏对变异点的有效防护的情况下，误入了异度空间，但没有证据显示是否是塔琴科所领小队。几个月后，克雷洛夫为了完成塔琴科的计划，再次参加摧毁变异区的行动，然而行动再次失败，克雷洛夫生死不明，纪律团高层出现权力真空。（注：另有资料显示克雷洛夫是死于派系战争，并非失踪，此处以塔琴科个人资料为准。）
2011年2月4日，军方逮捕大量普通潜行者，并关闭了大部分贸易站。2月13日，为了防止危机情况再次将临，以“教父”瓦莱里安为首的潜行者们在封锁线联合废弃区的贝斯和西里，成立潜行者联盟，潜行者第一次出现大型的阵线联合，但在派系战争期间，瓦莱里安在红森林地区被杀，具体死因不明，潜行者联盟随即解散。
另一潜行者指挥官奥雷斯特在农研所成立另外的潜行者组织。
2011年3月，以契科夫为首的一群潜行者占领黑暗山谷，并巩固在该地区的势力。同时加强废弃工厂的重建工作，打造为自由团的基地，随后，自由团在黑暗山谷宣告成立。
自由团成立伊始，和纪律团在理念和行为准则上几乎是相反的，由于双方成立之初都在废弃区周边活动，因此经常发生局部冲突。
2011年5月，自由团为了争夺废弃区的控制权，避免敌对势力扼制黑暗山谷的出入口，与纪律团和强盗同时展开激烈争夺，自由团与纪律团爆发全面冲突。由于自由团的战线过长，将自身力量传播的太薄，这使自由团在对纪律团的战斗中逐渐处于下风，而自由团所暴露的弱势使强盗首领尤加看到了颠覆自由团的契机。
2011年6月末，军方组织突击行动，企图通过利曼斯克绕过焦脑器抵达CNPP，但在利曼斯克遭遇黑石组织的强烈抵抗，再付出极大代价后军方最后下令终止行动，任务失败。随后行动指挥官在行动报告中提到了这么一则信息：“根据作战计划，直升机将运送一支SBU特种部队从利曼斯克北部进行渗透，联合南面部队夹击黑石组织。
行动期间，SBU在利曼斯克北郊发现一座废弃的医院，并攻克了设置在医院里的一个黑石据点，根据SBU指挥官的汇报，这座医院可能由于常年风暴地震和年久失修发生倒塌，一半建筑陷入地下。根据在黑石据点里发现的相关文件显示，这座医院曾是利曼斯克的一所精神病院，用来治疗利曼斯克当地居民的焦躁症和偏头痛，但实际上是无线电研究所下属的一个研发精神药物的实验室，在医院内部设有一个地下监狱，曾秘密关押过德军战俘和其它受试人员，进行活体研究。”
2011年8月，废弃区的强盗联合佣兵对自由团展开一系列偷袭，强盗的目的十分明确，希望通过排挤自由团从而霸占黑暗山谷，消除侧翼威胁。而佣兵则是为了黑暗山谷地下的X-18实验室。变异区军队由哈列茨基少校接手后，军方开始和强盗勾结，军方允许强盗绑架新手潜行者为奴或进行人口贩卖，甚至军方直接抓捕潜行者并贩卖给强盗。这激起了潜行者联盟的愤怒与报复，导致后来哈列茨基被瓦莱里安俘虏并杀害（实际上晴空里哈列茨基是放是杀由玩家决定）。
2011年9月3日，X-16实验室的生物场发射器因冷却系统发生故障，从而增加了该装置的PSI辐射输出，甚至可能刺激能量排放，威胁到了整个变异区。9月8日，史特列洛克小组第一次绕过“焦脑器”到达石棺外围，“C-意识”不得不进行能量排放，迫使史特列洛克小组从核电站撤离。此次风暴将正在沼泽的“疤脸”梅尔震伤，其所带领的科研小队全部死亡，梅尔被晴空组织救治。而风暴过后，各组织开始重新在变异区拓展疆域、划分势力、争夺资源，派系战争全面爆发。
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9月10日，梅尔在晴空组织的营地醒来，并接受了晴空组织领袖N.A.列别捷夫的指派，深入变异区北方查找触发辐射风暴的原因。
9月23日，在防御纪律团和强盗的同时，所有未安排驻防任务的自由团成员被召回，以抵御自由团在黑暗山谷遭遇的一系列神秘攻击。
2011年10月9日，史特列洛克小队第二次绕过“焦脑器”，并成功避开黑石的防线，渗透进石棺，抵达了进入“战争实验室”的密码门，这里已经非常接近“C-意识”，但是没有解码设备，小队只能再次撤离。在撤离过程中被“C-意识”发现，立即遭遇大量黑石成员的追杀，导致小队分散，“鬼魂”和“方”逃往木星，向导失踪，博士逃往大沼泽，史特列洛克逃往死城后被佣兵抓获。分散前，史特列洛克与其他成员约定在普里皮亚季的波利西亚酒店26号房间汇合，并将再次深入石棺，解开石棺背后的秘密，查清大灾变的成因。为了终结史特列洛克小组防止秘密泄露，“C-意识”给全体黑石成员下达杀死史特列洛克的指令。
10月14日，“鬼魂”和“方”通过红森林隧道逃往南方，又遭遇佣兵的跟踪和追击，“鬼魂”南逃杨塔被杨塔科学家萨哈罗夫拯救。“方”受纪律团救助后前往封锁线搜寻解码器，据说封锁线商人西德洛维奇能够出售任何物品。
10月23日，史特列洛克从死城逃离时身受重伤，在向导的带领下到大沼泽寻找博士医治（阴影当中的回忆片段显示史特列洛克曾满脸鲜血并被博士救治）。博士救治了史特列洛克但拒绝了同他再次前往石棺的请求，并留在大沼泽西北的图兹拉断桥下，等待史特列洛克及其他人员的归来。
10月25日，军方的一支巡逻队与一群潜行者之间发生了一场枪战，双方均遭受严重伤亡，军队授权前线部队可以对任何看到的潜行者进行攻击和追捕。
2011年11月，“方”找到并准备将特殊解码器藏在普里皮亚季的酒店内，与“鬼魂”在农研所地下（阿格雷普罗姆）会面后准备利用普里皮亚季地下一号通道到达北方，等待史特列洛克、博士以及向导。途中二人再次遭遇了跟踪他们的佣兵，“鬼魂”和“方”在逃离木星时给史特列洛克留下字条和部分补给。随后“方”被其中一名脸上带疤的佣兵狙击手射伤，在失去“鬼魂”和“方”的踪迹后佣兵留在木星等待史特列洛克的出现。
“鬼魂”带着“方”到达普里皮亚季后，“方”伤势过重最终死在了普里皮亚季的波西米亚酒店26号房间，“鬼魂”将“方”及其遗物埋在了酒店附近。
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2012年4月22日，受风暴释放影响的美国理论物理学家戈登·弗里曼死于罗斯托克-大荒野的地下车库，具体死因不明，推测可能因伤重得不到及时救治而死亡。
4月24日，由于晴空组织和史特列洛克已闯到核电站外围，“C-意识”将所有在外的无驻防任务的黑石机动成员全部调集回防，阻击晴空和史特列洛克的进攻。黑石组织的突然立即撤退，使自由团得到喘息，卢卡许立即趁机在仓库地区东北设立防线，防止黑石再次渗透及其他势力越境。
4月27日，晴空组织领袖N.A.列别捷夫率队追击史特列洛克至石棺，遭遇黑石组织的强烈打击和镇压，最后“疤脸”梅尔利用高斯武器摧毁了史特列洛克的PSI防护罩，但并未能直接杀死史特列洛克。眼看史特列洛克即将再次进入石棺内部，“C-意识”释放“智域”空间的能量，引发PSI辐射风暴。最后，史特列洛克和“疤脸”震伤昏迷，晴空主力和大批黑石成员阵亡，经此一役，晴空组织在不久后销声匿迹。
4月29日清晨，黑石组织开始清理战场，一些在战斗中受伤、昏迷的潜行者被黑石组织救治并洗脑，其中包括“阵亡”的梅尔和史特列洛克，所有新洗脑成员的PDA同样被统一植入了“杀死史特列洛克”的任务，利用“死亡卡车”将新洗脑的受试者运到变异区其他地方。“疤脸”梅尔被重新洗脑后取名“卡隆”，因其自身的特殊体质和战斗素质，被派往普里皮亚季的文化宫担任该地的黑石指挥官。
2012年5月1日凌晨5点30分左右，一辆通往封锁线的“死亡卡车”在路上发生雷击事故，车上的史特列洛克被一名过路潜行者和封锁线商人西德洛维奇救下，并取名“一号”。患有重度失忆和轻度焦脑的史特列洛克（一号）受商人指派，探索通往变异区北方的道路，同时变相的追查传奇潜行者组织——史特列洛克小队成员的下落。
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5月3日至9日，由于长期的派系战争，纪律团和自由团损失重大，而最根本原因在于双方都无力一口吞并对方，一旦其中一方攻占对方领地，将要付出更大的代价进行更广阔的防御，而目前双方均无这样的力量来消化这样的结果。为了各自的利益，纪律团领袖沃罗宁与自由团首领卢卡许举行谈判，双方签署停火协议，休养生息。但纪律团内部以“骷髅”为首的部分成员仍然不服从命令，不断与自由团发生冲突。
5月12日，乌克兰国家安全局V.M.克鲁切尔尼科夫上校获悉农研所地下有一个秘密实验室，于是派军队突击农研所，并建立营地。不久，农研所地下未来得及摧毁的秘密实验室次入口被军方发现，D.F.梅克赛门克上尉派遣一支小队深入地下进行调查。但一些在实验室被毁期间偶然释放出来的基因实验体开始屠杀士兵并造成恐慌，最后甚至发生逃兵现象。
5月26日，D.F.梅克赛门克上尉完成农研所调查报告，报告如下：“经调查发现，2005年至2008年期间，农研所并未进行任何和农业有关的官方科研项目，所有送到国家农业部的“工作”都是伪造的，大部分的仪器设备和文件缺失。
但农研所的负责人彼得·丹尼洛维奇斯·特里茨依旧从政府接收资金、物资以及设备的供应，并利用伪造的托运清单将大量资源转移至X-18实验室，通过指示材料将这些物品用来辅助X-18室进行研究。X-18实验室距离农研所大概一小时车程，但我们的内部数据库并未提到X-18实验室的任何情况，可能是一个秘密设施，其地理位置不明，内部构造不明，研究领域不明。现有情报在这方面也未能找到重要线索，只是提到了臭名昭著的瓦迪姆·米哈伊洛维奇·楚博克教授和一些关于“集团”的只言片语，分析部门需要开始大量的工作了。”
这份报告的出现，标志着“集团”组织的揭露。报告一式两份，其中一份在完成后送往封锁线南部哨所提交V.M.克鲁切尔尼科夫上校，另一份存放农研所办公大楼。
5月28日，史特列洛克侵入农研所军营，盗取梅克赛门克的报告（一个白色公文包），D.F.梅克赛门上尉和众多军营士兵被杀。
2012年6月末，伯罗夫死后的强盗组织四分五裂，苏丹带领部分强盗活动于河湾地区，勾结商人“猫头鹰”排挤当地潜行者，并逐步取得优势，势力范围扩至亚诺瓦附近。木星地区则被杰克和舒沙克瓜分，相比伯罗夫时期的强盗，杰克和舒沙克领导下的强盗不那么混乱和暴力。
2012年7月9日，在探索通往北方道路的期间，史特列洛克成功关闭X-10实验室的焦脑器，打开了变异区外围通往核电站的主要道路之一。随后，军方、独行者、自由团和纪律团等同时出动大量精英前往天线和普里皮亚季，企图控制该通道，“集团”则通过驻扎在普里皮亚季和周边的大量黑石部队，反击各大派系进入变异区核心。各方在天线和普里皮亚季地区展开激烈争夺，爆发了自2011年派系战争以来最大最强烈的冲突。
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7月16日，渗透进石棺的史特列洛克（一号）到达了“战争实验室”，见到了“C-意识”并与之交谈，期间获悉了“集团”组织的真实内幕，拒绝加入“C-意识”，并将“战争实验室”和“C-意识”的全息影像摧毁，但是“C-意识”的连接实体依旧存在，并未彻底消除。最终，史特列洛克通过石棺顶部的虫洞找到“C-意识”7名志愿者的意识连接器（实际上可能不止7名），并将其破坏，“集团”组织严重受创，但黑石组织依旧存在，“许愿石”未被摧毁。
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同月，乌克兰在国防部和国家安全委员会内部环境更迭之后，制定了军事行动计划，发动代号“坦途”的军事行动。“坦途”行动旨在利用大规模的空中力量运送和配合地面部队攻占切尔诺贝利核电站，使其全面控制在政府手中（也可能是军方想自行控制CNPP），但由于空中攻击单位因未知原因而纷纷坠机，仅地面部队和一个空中部队成功抵达CNPP，行动最终失败。（注：行动代号“坦途”，少将指挥官代号“四重奏”，由七个空中攻击单位，三个地面攻击单位，一个狙击支援单位组成。这可能就是阴影当中，史特列洛克到达核电站时，出现军方进攻核电站的背景。）
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2012年8月1日，乌克兰政府派遣一位USS中校特工——亚历山大·德格特雅里夫进入变异区调查“坦途”行动的失败原因。
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2012年10月，德格特雅里夫救出“坦途”行动空军指挥官——上校科瓦尔斯基和剩余的军队人员，随行人员中包括史特列洛克。德格特雅里夫中校由于成功实施了调查行动而被晋升为上校。
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在撤离行动中，德格特雅里夫从史特列洛克处得知了变异区的一些秘密，彻底解开“坦途”行动的失败原因。在随后的报告中总结了失败的原因主要来自两方面：一是黑石组织研发的高斯武器可以击落军方的直升机，二是大风暴过后，电离层会发生辐射凝结，所有的变异点均会出现位移，所以原先根据变异点测绘的地图已无法使用，当风暴过后，直升机遇到变异点后使电子设备出现瘫痪而无法使用，直接导致坠机。
德格特雅里夫中校最终得到了高斯电磁武器系统的情报，由于害怕他发现真相，所有关于"X实验室"的情报和相关资料都被从军队档案馆中移出，并且统统标上"无限期最高机密"的字样。在变异区的所有USS单位被命令要不惜一切代价防止目前的所有信息被泄露。
随德格特雅里夫撤离的史特列诺克把在核电站里弄到的关键数据和情报交给了政府，这些数据促使政府建立了一个切尔诺贝利变异区研究机构，他有幸成为了首席科学顾问。
2012年11月，祖鲁返回了纪律团的主基地。没有人知道他和沃罗宁的谈话内容，只知道几天后祖鲁带领着大队的纪律团战士向变异区中心地带进发了。
编年史到目前随着三部曲的结束已经基本完结，结局是开放的，就如同游戏的模式一样自由遐想。三部曲也未提到所有相关结局信息，除了潜2没有谁知道后面还会发生什么事。
派系简介
派系简介
最后是对编年史中出现的派系的一些简介
一、集团
“集团”（英文TheGroup），是指苏联解体后在切尔诺贝利隔离区内成立的，以秘密实验室和秘密研究项目为主的组织的非官方简称，是整个S.T.A.L.K.E.R.系列的最大反派和最强存在。其前身是苏联政府的秘密科研机构，最高领导人不明，起源可追溯至二战后期。
“集团”组织集合了当时苏联境内和部分欧美国家在遗传学、神经学、基因组学、生物学、生物化学、生物物理学、核物理学、电磁物理学、电子科学和武器学等领域内的一大批优秀科研技术人员，分别在“生物医学工程”、“电子通信工程”、“生物基因改造工程”三大项目上进行一系列的科学研究和产品研发。同时，为了更好地进行秘密研究、保护实验成果，以及清理失败的实验产品，成立了“战争实验室”，旨在研发生产新式尖端武器，培训和募集军事专家，建立自己的安保组织——“黑石”，并创造了“C-意识”——一个超级意识体，担任“战争实验室”主任，领导黑石组织。
“集团”的最终目的是创立“共同意识”，通过优化人类思维、去除负面情绪、消灭战争，犯罪和腐败等问题，以达到控制全球意识的目的。
“集团”三大科研项目：
Ⅰ、生物医学工程：旨在通过辐射和电磁辐射对活体神经的影响，研发出可控的生物电磁辐射波，对动物特别是人类的大脑思维产生改变甚至改造。同时研发出一系列精神药物，用以辅助科研人员进行意识研究和抵抗来自实验的伤害。
Ⅱ、电子通信工程:旨在利用大气层的笼罩和“智域”空间的作用，结合电子信息与通讯技术手段，建造大型发射器系统，陆续将带有辐射效应的生物电磁波发射并覆盖到世界各地，从而影响人类思维。该项目部门联合生物医学工程部门共同研发出“凯曼诺夫”实验发射器（X-18实验室的圆筒形实验箱）、生物场发射器（X-16实验室的大脑）和“彩虹”发射器（X-10实验室的焦脑器），以及“许愿石”(石棺中的黑色复合晶体）。
Ⅲ、生物基因改造工程:旨在对包括人类在内的活体动物，通过辐射变异和生理结构的人工改造，生产出拥有超能力的生物兵器，即用来进行研究，也用来保护“集团”的实验，抵御和反击包括政府在内的各势力进攻。
该项目部门的产品包括控制器、奇美拉、史诺克、狂暴侏儒、巨型地狱犬、吸血鬼、PSI地狱犬等。
“集团”主要秘密研究机构：
- X-7实验室（新总部，位置不明，疑位于第一次大灾难核心或利曼斯克无线电研究所）
- X-8实验室（中央实验室）
- X-10实验室（即X-19实验室，“焦脑器”所在）
- X-16实验室（PSI电磁辐射诞生场所，后期废弃）
- X-18实验室（研究项目最多的实验室，后期废弃）
- 农研所实验室（后期被毁，合并到X-18实验室）
- 战争实验室（又名黑石控制中心，黑石组织的指挥中枢，“C-意识”所在，后期被毁）
“集团”主要领导成员：
瓦迪姆·米哈伊洛维奇·楚博克教授（高级主管，疑为“集团”创始人、最高领导）
N.A.列别捷夫教授（高级主管，X-8高级研究员，高斯步枪研发者之一，曾参与利曼斯克无线电研究所工作，后离开，创立晴空组织。传言其前身为克格勃官员。）
皮欧特·里奇·卡鲁金博士（高级主管，X-18主负责人）
O.O.多布列宁博士（高级主管，疑为X-16主负责人）
V.I.苏斯洛夫教授（高级研究员，X-18分管负责人，后离开，创立晴空组织）
E.F.卡兰察教授（高级研究员，X-18分管负责人，后离开，创立晴空组织）
A.N.伯诺夫博士（高级研究员，X-18技术主管）
彼得·丹尼洛维奇·斯特里茨博士（高级研究员，农研所实验室负责人）
二、潜行者
独行者或自由的潜行者是指在变异区范围内活动而尚未加入其他组的独行人员，因为加入组织会占用珍贵的时间和分享战利品，所以大部分的潜行者都一个人行动，总是会有一些单纯喜欢孤独和独立行动的人。当然在受到威胁时除外，因此潜行者也常常被各种各样的派系征召。潜行者们几乎对所有的派系都持中立态度，但和军方有冲突纠纷，因强盗的无耻行为而向强盗们宣战。潜行者们会自己探索变异区，尽管经常受到突变生物和其他潜行者组织的骚扰，但依旧有一些小团体设法在整个地区建立了强有力的交易据点。
在派系战争前夕曾一度成立过以“教父”瓦莱里安为首的“潜行者”阵营，但因其独行者的独立本质，该组织内部并不稳定。派系战争之后不久，因瓦莱里安的死亡而导致权利真空，部分组队指挥官相继离开，最终土崩瓦解。
三、反叛者
反叛者是一群没有加入其他主要的派系或者被其他派系驱逐的潜行者，他们以战团或者帮派的形式存在，主要活动于变异区的一些偏僻地带。该组织（甚至不能称为组织，因为他们没有任何领导）有几分强盗的本色，他们抢劫潜行者，攻击其他团队，因此在变异区很快遭遇各大派系的镇压与打击，派系战争中其势力被基本摧毁。
四、强盗
变异区的黑社会成员，他们来自世界各地，到变异区出售神器赚钱，躲避法律甚至买卖武器和毒品。变异区里到处都是强盗，从一般的打手到的可怕罪犯，虽然在变异区的不同阵营之间常会互相攻击，但对一个普通的潜行者来说，犯罪仍然是变异区中最严重的问题。大多数强盗都是没有组织没有领导的，只有极少数已知的强盗头子和营地。
即使是这样，这些团伙仍是十分涣散，经常有争夺领导权的争斗发生。他们的武器装备一般都是便宜的劣质货，因此主要靠人数优势袭击小团队，他们的营地也一般都在主干道附近的地方，方便抢劫过往人员。
五、晴空组织
变异区中最早的组织，也是最为神秘的组织之一。该组织在派系战争的一系列事件中损失了大部分人力之后就解散了。晴空由“共同意识”的前研究人员创建，这些研究员脱离出来想自己进行研究，既不摧毁又不包容变异区，希望维持变异区的稳定。其他一些成员是一些因为自身各种原因加入晴空的流浪者。
六、自由团
无政府主义者跟一些不怕死的人宣称他们的战士想要自由进入变异区，结果发现他们自己很快的就遭遇到了军方和纪律团以及黑石组织的打击。这些自称为自由团战士的人相信变异区的一切资讯都应该同全人类共同分享，而且不满于政府垄断了所有有关变异区的秘密和超自然奇迹。
七、纪律团
纪律团是一个准军事化的组织，它的成员大部分都是退伍的军人，依据严格的规定来生活，纪律严明。纪律团的成员是唯一拒绝将神器交易到变异区以外世界的组织。根据谣言，这个组织所发现的一切神器都交给了科学家，并且和乌克兰军方有着不同寻常的往来，其成员以保护外面世界免受变异区伤害为首要件。该组织的大部分任务都是杀死变异生物跟盗匪，解救了不少陷入麻烦的普通潜行者，你可以把他们看作是变异区的警察，这个阵营跟自由团长期敌对。
八、佣兵
雇佣军是变异区最专业的战士之一，是变异区中最神秘、最隐蔽的阵营，其背后领导者和雇主不明，有些人甚至不承认他们的存在。他们为雇主提供优越的服务，包括获取科研资源、刺杀、勘探地下设施等，甚至试图找到秘密实验室以及相关的实验数据，只要价钱合适。把他们当成是专家的人定期会雇用佣兵团的服务，可以快速的对付任何潜行者，甚至歼灭一小群对手。
他们的服务并不便宜——佣兵团会要求国王等级的佣金，他们的服务通常用金钱或是等价的神器来支付。他们基地的位置一直是个秘密，据说位于变异区深处的某个地方。在变异区里不断出现的佣兵团曾引起乌克兰USS的注意，但经过多番努力后，USS还是无法得知这些人的幕后操纵者是谁。
九、黑石组织
这个组织显示了许多宗教学派的特征，其成员有着狂热的宗教崇拜，成员们相信并保护一个座落在核电站内部的某个地方，能够实现任何愿望的外星复合水晶的存在——许愿石（亦称黑石，是黑石组织的名字由来），大多数的潜行者用轻视的态度看待黑石组织，并且把他们当成疯子。
这个组织一开始努力阻挡所有前往变异区中心的步伐，保护许愿石不让任何组织和个人接近。谣传说他们在变异区深处有一个大型的基地，并从那里不断得到大量的补给和人员的补充，但确切的位置只有其成员才知道，在天线、利曼斯克、普里皮亚季等地设有分部。尽管黑石组织的首脑“C-意识”被史特烈洛克摧毁，但是残余的黑石组织仍然准备复兴，企图夺回许多曾属于他们的东西。
十、军队
一般的军队士兵，乌克兰国防部通过内政部与来自国家安全部门(如USS)的安全部队联合驻扎在变异区周边地区，守卫着所有进入变异区的通道和路口，在四周巡逻、杀死异种生物和追捕强盗，并且辅助政府的科研人员进行研究活动，甚至出动武装直升机以及步兵坦克扫清障碍。
乌克兰特种部队，军队中的精英部队，装备极其精良，团队作战能力突出，通常被派到变异区来执行拯救任务和特种突击任务，并拥有强大的战略资源和火力支持，可出动武装直升机直接空降到变异区任何位置，是整个变异区除黑石组织外最强大的机动力量。
军队潜行者，针对变异区条件而接受特别训练的士兵，或是跟陆军签有秘密协定的潜行者，他们跟着大部队在变异区工作。在过去主要是研究大灾变的成因和影响，为军方测绘变异区地图，后来开始渗透进各大组织刺探派系情报和动态信息，收集地下实验室数据，甚至对敌对组织和设施进行秘密破坏。军队潜行者通常拥有数种支援配备和精良的武器，他们可以独立工作，或组成五人一组的小队，他们通常不允许普通潜行者接近，而且一看到就会开火射击。
十一、生态学家
一群受乌克兰政府或者国际科研机构资助的研究团队，希望通过对变异区的研究和科学运用，来为人类创造更美好的贡献，对变异生物和神器最感兴趣，曾大量采购不同属性的神器甚至稀有神器，并寻找资深潜行者进行区域探索和搜集实验数据的任务，奖励一般都很丰厚。
生态学家们几乎生活在移动实验室里，由一个小型、带有装甲、有着脏玻璃的小窗户的碉堡改装而成的，并配备有完整的科研实验设施。这种实验室可以抵御大规模的攻击，它可信赖维生系统可以自动工作好几个月，可以说是科学家们在变异区的天堂。碉堡由运输直升机运送到变异区中的，实验室的科研成员从不轻易让访客通过主入口的气密室，所以几乎没有普通潜行者进去过里面。
十二、僵尸潜行者
由于长期暴露在PSI污染区域和高辐射区，人类大脑的大脑皮层、脑干以及神经元遭到极大破坏或变异，导致大脑坏死。这些缺乏照顾的潜行者开始变得焦躁和疯狂，最后变成了活死人。经常能看到穿着不同组织服饰的焦脑潜行者在变异区里游荡着，有些则游荡到了变异区边缘地带。他们没人帮助，因为这些辐射造成的伤害是无法治疗的。焦脑化的潜行者仍然保留着枪械的基本使用方法，但他们变得很笨，而且总能听见他们口中发出无意义的声音、和不完整的句子。他们逐渐会失去所有的技能而变成僵尸，这些可怜的灵魂通常非常易怒，在数量很多时会造成很可怕的威胁。
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