视频包含剧透内容
游戏大概发生在1987年（主角日记记录时间）的波兰某个地方。外星人造访太阳系，在这里丢了一堆垃圾之后便扬长而去。
这片区域本来民风淳朴，现在却溢满宇由尘埃，弥漫瘴气。洪水旱涝，让本来物资短缺的村落更加捉襟见肘，这对生活在这里的人生命造成了极大的威胁。但是让当地政府震惊的是，这块被外星人造访过的区域，居然被森林密密匝匝地封锁了起来。外面的人没有办法通过常规路径走进去，里面的村民也鲜有逃脱出来者。
被困在森林里面多年的无助村民，为了食物，为了活命，为了治愈瘟疫，为了生的希望，他们旧神改新神，投奔各自的信仰；他们吃树皮，甚至人吃人，在人性边缘，和禽兽为伍，残害生灵，无恶不作。
这块森林包裹着的一切，已经变成了一片人间地狱。但是就算黑暗笼罩了大地，还是有一丝人性的光辉冲破了乌云：这里有追求医德，尽管最后心力交瘁的医生；有追求梦想，制造火箭打算飞到外太空的小男孩；也有恪守亲情，追寻亲人的鸡夫人；更有对“爱”执着的音乐小男孩；即便变异后，却对自己的“丑”，自惭形秽的俏夫人。
是这些人的存在，点亮了阴暗森林的路灯，守住了这里留存的一丝人性和作为人类道德的底线。
[狼人]
狼人说，整个森林都是他的，多么狂妄却又真实的一句话。
狼人从数次战争中存活了下来，这锻炼了他的意志力和顽强的生存能力。他在森林的每一块区域都有自己的藏身处和露营地。他有AK47，有众多先进武器，他似乎所向无敌，这倒是没有吹牛。狼人代表了那些玩世不恭，贪得无厌，却又具有先天优势的人，在这个残酷的森林世界，他就是真正的大恶人了。
所以，他是那个最不想阴暗森林有任何改变的人，他乐于生活在乱世，并享受其中。
狼人踪迹几乎遍布整个森林世界，他似乎无所不知，只不过他被自己的私欲给耽误了，不然一定是一个救世主。狼人喜欢玩弄对手，不管是他嫉妒的对手，他仇视的对手，还是他轻蔑的对手，这一点，我们主角在锯木厂可见识过了狼人的威力。他贪念很重，对于想要得到的东西，他一定会想方设法的得到。他对爱情似乎也很执着，不然他为何会把一枚粗糙的戒指一直戴在身边？
当主角选择讨好狼人，把俏夫人门房的钥匙给他之后，狼人一刻都不想在露营地待着了，他不顾主角，很着急地跑不见了，再也没有出现在寂静森林的每个角落。主角在老森林的北方时，路过了一座废弃的房子：这里是谷仓废墟，主角绕了几条小道，杀死了几只攻击力强的巨犬，在谷仓最深处发现了狼人的大本营。
主角打开了发电机，趁着灯光来到了狼人的小院子里，这里装饰的阴森恐怖，门口摆着几具尸体制成的标本作为炫耀的战利品，都塞满了奇怪的防腐物。
主角小心翼翼地推开西门，走进去，里面霓虹灯刺眼。角落里摆放着一具被啃食掉一半的畸形女，这不就是狼人心心念的俏夫人吗？ 但是狼人为何会吃掉俏夫人，主角一脸狐疑。其中一个可信的推测是，俏夫人以前本来美若天仙。
但是当狼人见到已经变异的俏夫人，他大失所望，原来他喜欢的只是俏夫人的外在皮囊，这么多年的努力似乎都白费了。“可惜了俏夫人白白嫩嫩的肉蒲团，万一变异了或许会用血盆大口把自己给吃掉”，狼人是这么想的，不如就先下手为强吃掉她吧。
另一个可信的推测是，狼人残忍奸猾，贪婪好吃，就像他吃那些触发补兽夹子的巨鹿一样，他从来都会为了美食不惜一切代价。当主角从藏有俏夫人遗体的房子里出来后，他发现，原来狼人一直站在门口的椅子旁边等着主角。
主角向狼人打招呼，狼人骄傲地大声感谢主角送给他的这份大礼。一边说着，一边流着哈喇子。狼人还戏弄地把他吃撑了的大圆肚子顶着主角瘦弱的身体，不过主角厌烦地一把推开了狼人。狼人后退了几步，开始嘲笑起主角，他说主角不是人，只是现在假装是人而已，让主角不要自欺欺人了。
不过，狼人最终还是兑现了他的承诺，他答应帮助主角找回打开出口的钥匙，并指引主角找到了医生 。
但是，当主角选择把钥匙给音乐家之后，气急败坏的狼人会在主角到达沼泽地之后，偷偷潜入主角的工坊偷走他的一些物资，留下一封措辞不太好听，略带威胁的信。
等到主角全副武装来到锯木厂之后，工于心计的狼人又让主角把所有武器装备都放在门口的一具干尸上，不然不准见他，并且把两道门全部都反锁了。
狼算不如天算，主角早都在锯木厂的周围放置了很多捕兽夹子，以其人之道还之彼身。轻蔑主角的狼人反被主角猎杀之后，奄奄一息，他这辈子估计都想不到杀死他的居然是眼前这个笨蛋。
从他遗落的小提琴物品，我们似乎推断，他已经吃掉了音乐家。
[鸡夫人]
鸡夫人似乎代表着人类的亲情在阴暗森林里最后的守护所。她有一个弟弟叫雅尼克，一个妹妹就是大名鼎鼎的，游戏里最迷人的俏夫人，是她俘获了音乐家，狼人和玩家们的芳心。
鸡夫人一直在寻找自己迷失森林的弟弟，我们在序章已经知道，她的弟弟已经死在了医生家里，并且是主角亲手杀死的。
主角在村里的一栋养鸡舍见到鸡夫人的时候，当时这位老太太眯着眼睛看著主角，肩膀上站着一直鸡，她的眼里充满了疑惑，这人到底是谁。
她让主角离她的鸡崽子们远一点，她爱鸡如命。别以为鸡夫人是吃素的，她可以大口地吃村里老母猪产的肉，并感谢神灵，能在这种饥荒年，赐予她猪肉吃。
主角还听她就此唠叨过几句：
感谢主赐予我们母猪！可爱的东西，她看起来很虚弱。但你要问我的话。我要说她比我们任何一个人都更加活力百倍！多亏了她，我们这些日子才有东西进锅里煮。当主角把一只小黄鸭玩具交给鸡夫人的时候，空气中瞬间弥漫着一股杀气。鸡夫人质问主角，你这个玩具是在哪里找到的，这是她之前送给自己弟弟的礼物。
她告诉主角，弟弟前几天突然疯了，他说要跑去找那个医生，鸡夫人怎么劝阻怎么拦都拦不住。鸡夫人一边给主角诉说着哀愁，浑身颤抖个不停，肩膀上的那只鸡在努力保持着平衡。
她说她只有一个亲人了，那就是她的妹妹了，她不能再失去她的妹妹。鸡夫人又对主角说，他这辈子经历过不少事，她见证了很多场战争，但上帝作证，这个受诅咒的土地不是人和鸡住的地方。
当主角选择送钥匙给狼人，俏夫人消失不见之后，鸡夫人会再次拜托我们主角寻找俏夫人。当她认为谁也帮不了她的时候，鸡夫人会离开了自己守了几十年的老房子，亲自前往森林里寻找自己失踪的妹妹。
当主角把钥匙送给音乐家之后，鸡夫人会一直守在妹妹身边，直到有一天，饥饿的村民吃掉了鸡夫人的鸡崽子们。
鸡夫人最终成为了变异后的俏夫人的最后一餐。也许，鸡夫人至死，都在守护亲情的路上。
[小小音乐家]
印象最深的就是小男孩刺耳的小提琴声，盖过了森林里的鬼哭狼嚎，给人一点点安慰。
小男孩代表了那些为了梦想的不自量力者和天真的执着家。值得肯定的是，他们虽然笨拙，也羞于表达自己，但是他们对自己的梦想却会义无反顾的践行。
对于像小男孩这样的人，我只想说，不管成功与否，人嘛，最重要的是开心就好。他的家庭应该不是多富裕，不然他也不会说长大了要赚多少钱，买好多东西，父母生前应该也是节衣缩食的人，不过这个家庭是爱音乐的，从他母亲私藏的那把精美的小提琴就看得出来。
我们从小男孩用面具遮住自己日渐凋零的面容，可以看出他是多么羞怯，他怕别人说他是怪物，他怕伤了敏感的自尊心，他善良，他认为医生一直都是好人。
小男孩也喜欢和人玩耍，村里现在已经没有小孩子了，他就和大人们一起玩耍，但是能跟他一起玩的人，最后一个个都不见了，寂寞的他，也只能拉拉小提琴安慰自己。如果森林里没有发生外星人的入侵事件，那么小男孩一定跟我们普通的孩子没有什么两样：在青春期充满了对爱的渴望。
他在鸡夫人后院的拖拉机旁边拉琴给俏夫人听，他一直做着那个迎娶俏夫人的美梦，见到主角，不忘告诉我们这样一件事，是鸡夫人活生生拆散了他和俏夫人。并且希望主角能够帮助他找回钥匙，他很想见一见俏夫人。
小男孩心存对美的幻想，这在这样的残酷世界是难能可贵的。他在谷仓里，整天拉扯吱吱呀呀的音符（主角在干草地就听到过这“悠扬”的乐声）。
其实听起来确实蛮刺耳的，但是当主角发现这把琴并不是真正的“琴”，我们的耳朵也就原谅了小男孩。小男孩也知道他的琴根本拉不出美妙的音乐，就央求主角去拿他家里那把精美的，真的能拉出动听音乐的琴。
他一直对俏夫人有爱的执念，也一直都是一个思念着父母的好孩子。据说，后来，他不考虑俏夫人变成怪物把他吃掉的风险，依然带着她远走高飞了。
如果主角选择不帮助小男孩，失望的小男孩会扔掉自己的小提琴和留声机；他会独自一个人倾听大树传来的那些低语，慢慢沉沦下去。
如果主角选择给小男孩钥匙，并且从他老家里带回那把漂亮的小提琴。小男孩会去找俏夫人，给她拉奏小夜曲，小男孩最终会变成一坨肉样的怪物。其实一直有个疑问，在阴暗森林里，是否存在一种选择性变异？这种选择性变异是否能解释小男孩为何没有最终变成吃人的变异体？
当主角选择帮助小男孩到他家里去借精美的小提琴。小男孩的家坐落在老森林里一个不起眼的角落，是一栋破损不堪的老房子，主角走进去：在门口，他的父亲似乎已经死了，但还是有一丝微弱的呼吸。在最里屋，小男孩的母亲奄奄一息躺在浴缸里，她已经在水里待了很长时间了。当主角推开浴缸前的桌子，小心翼翼拿下挂在壁龛上那把漂亮的小提琴时，他的母亲会变成裂头人袭击主角。但是在拿琴之前，当我们把小男孩嘱托给主角的那副画作交给这位母亲之后，她会安心睡去，仿佛没有发生任何事一样。
主角站在一旁，很诧异这种差异，这是否可以作证，阴暗森林里的人可以根据心底里的欲望，变成内心真实的样子。比如贪婪好吃之人，死后会变成想要吞噬一切的怪物（暗示狼人）。
有强烈的负面执念的人，死后会变成吃人的怪物？
[象人一家]
象人一家的所作所为，是最让人细思极恐的，世人的残酷，象人的无助，似乎促使她变成了比那些村民更恶的人。
她和孩子们戴着防毒面具，相依为命。她们躲在四周都布满陷阱，阴暗潮湿的房间里，是什么让他们活下来的？当主角第一次见到象人一家的时候，似乎也有这样的疑问，那些氧气又是从何而来呢？她因为家里生养的孩子比较多，在沼泽地闹灾荒的时候，粮食不够吃，当时村里负责集中分配食物。孩子多就得分配更多的粮食，这应该才是她们一家子受到村里人排挤的原因。
她认识村里的每个人，每个人都长着一张厌恶的脸，每张厌恶的脸上又写满了厌恶她们一家子的厌恶。这个可怜的女人，身边这么多的孩子，每个孩子一张嘴就得吃东西，那怎么办了？孤苦无依，没有了旧的信仰和道德束缚，只能自己救自己了，就算牺牲自己的骨肉谁又来管她呢？
她的这种恶违背了“虎毒不食子”的常伦道德底线，她的这种恶来的无可奈何，让人厌恶又唏嘘。她知道森林里布满了宇宙尘埃，空气受到污染了，呼吸这些空气，能让人迷离，也能让人发疯，甚至产生变异，她不想变成那些可恶的村民。
最开始，她把研究员的尸体放进大染缸里面，混合一些植物进行“土法”发酵，并用这些该死的研究员带来的氧气罐吸收尸体发酵出来的有机氧气，她身边带着三个孩子（有人说6个孩子），一开始氧气是充足的，但总有不够的一天。那一天到来之后，有机氧气的原材料在哪里去找？
这女人想来想去，她看了看自己膝下那好几个孩子，只能忍痛让“爱”发电了。她通过抓阄的形式，选择了牺牲自己的第一个孩子，就用地上的被子捂死孩子吧。她把孩子扒光衣服扛到大缸里，如前一个研究员那样，肿胀的尸体开始散发出氧气。
对这间小棚屋里散发的腐臭和花香的混合味道，她已经习惯了，每次缺氧的时候，她都会独自一个人来这里给养。她还教会了孩子们唱儿歌，万一她不小心死掉了，孩子们还能自己打开这间小棚屋来采集氧气。
她变得冷血，残酷，用孩子的身体养活其他孩子和自己，似乎在这样的环境下，我们主角也没办法用现在的道德眼光去批判这样一件道德沦丧的事。但是主角可以不管这样一件事：至少这个女人在央求他，帮她找回独自跑出去的孩子。知道真相的他，完全可以拒绝她的要求。
或者选择杀死女人 。这象人，似乎已经不是，也不能算是人类了，活着的意义在哪里？等几个孩子陆陆续续死掉，最终完成发酵的任务？
然后，不也还是死路一条吗？这种困境，这样的境地，怀着这样侥幸的希望，象人选择了一种非人的寄生手段。
也许，她的选择是无奈之举？也许，主角也无从批判，反正象人已经非人，反正换做是别人，似乎...也会发生同样的事情。
[医生]
医生曾经是一个外来者，后来和当地的村民打成了一片，远近闻名，受人尊敬。他是这个森林里唯一的医生，这场灾难没有发生，他绝对能得个千古良医的称号。
他有妻子和女儿，本来拥有强大的意志力，但是，经过一系列的变故，最终他的意志力也被摧毁了。当主角第一次和医生见面的时候，是主角从野人袭击营地事件中逃脱出来，饥肠辘辘，走投无路的时候，也是医生救了他。
医生不仅救了他，还为他打了一针抵抗饥饿感的药剂。
但是，医生把主角绑了起来，他早就看穿了面前这个所救之人就是那些让人憎恶的研究员。于是医生顺手拿走了主角那把也许能够逃离森林的21号钥匙，并逼问主角森林的出口在哪里。此前，他一直往返于寂静森林和老森林之间，这两个区域染上瘟疫的病人需要他去救治。他打算用此前对待那些感个冒发个烧的病人一样的方式，用自认为高超的医术和高尚的医德去救治他们。
但是现在，病人的情况有些不同，病症也不再是感冒发烧肚子疼那么简单明了好治疗。他需要花时间去研究这些瘟疫，研究死掉的尸体，研究这片森林，才能对症下药。他似乎是那种想要实现“救死扶伤崇高目标”的人。刚开始那些得了瘟疫的病人很信任他。
但是随着病人的病情加重，病人的痛苦有增无减，病人一个个，或变异，或死去。医生开始怀疑自己没有那个能力，没有那个金刚钻，还要揽这个瓷器活，去救他们？是不是这么多年的努力都白费了，是不是自己无能到，面对这场灾难居然一点用处也没用？医生就这样怀疑着自己，怀疑着周围的一切。
但是随着病人家属们不间断的抱怨和辱骂，他们从最初对医生的信任，到现在，却都变成了一种怨愤和仇视。
没有能力为什么要给我们开药方，没有能力为什么要接纳我们，教堂惨案历历在目，病人和家属们开始寻找另一种“解药”。他曾经给俏夫人治过病，但是他没有办法治好这种病，俏夫人在剧烈变异，他只能控住她的手，给她打点镇定剂。
有一天他去看望俏夫人的病情时，站在一旁的鸡夫人一见到他就破口大骂他，“你这个骗子，一点用都没有”。可见，当主角出现在寂静森林的时候，医生，在这个地方，不再是天使的化身，成了连魔鬼都不如的无能之辈了。看到一具具尸体，一声声的辱骂。这个时候，医生的内心更加崩溃了，他的信仰也慢慢凋零了，连他家的狗子，也马上要死了，他都无能为力。
他开始出现间歇性精神分裂症，他给求医的病人胡乱开一些奇怪的药方，反正吃不死人，反正这些人都要死，就当是安慰剂也好啊。
他对瘟疫的研究也没有任何进展，他心如死灰，现在立刻马上就想离开这片受到诅咒的森林，他想念他的女儿了，她是那么可爱，之前森林里就一直传来他女儿的呼唤。总之，他下定决心要走了，他打算去那些曾经藏在地下，又从地下爬进森林，找到从树后面观察村民们举动的研究员的营地，找他们谈谈或者打探一些消息。现在，留给他的时间也不多了，趁着自己还没有发疯或是变异，他必须找出出路。医生在森林里探索的时候，救了主角，并且拿走了主角身上的21号铁门钥匙。后来，医生和主角达成共识，一起通过了21号地下通道，逃到了沼泽之地。
医生本来的希望是，21号门出去，就是外面的世界，但是他发现沼泽之地仍然是另一个寂静之地，古老森林，甚至比那些地方还惨不忍睹。
他看到腐蚀大树挡住了去路，他似乎找到了另一种平静，他似乎接近另一个真相了。
他折返到主角在沼泽的营地。信仰不再，精神奔溃的医生开始胡言乱语，开始吃树皮，身体开始向野人的外貌形态变化，他认为阴暗森林的树和树之间通过某种有机电流连接在一起，森林里的人都是假的，虚幻的，不是真的，真正的他们，也就是他们的本体都躲在地底下，都被大树控制着。也许，医生说的是对的，也不全对，毕竟他已经是一个靠着吃“木头”活下去的人了。医生作为一个乐于奉献的人，阴暗森林的出现却让这种无私变成了“伤害”，这是医生的可悲之处。
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